Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms