Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx6Q9ER75 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx6Q9ER75 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms