Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pak1ip1Q9DCE5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pak1ip1Q9DCE5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1ip1Q9DCE5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1ip1Q9DCE5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1ip1Q9DCE5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1ip1Q9DCE5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1ip1Q9DCE5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1ip1Q9DCE5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1ip1Q9DCE5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pak1ip1Q9DCE5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms