Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SrpraQ9DBG7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms