Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1451.2 ms