Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AplfQ9D842 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AplfQ9D842 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms