Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl40Q9D783 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl40Q9D783 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms