Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc3Q9D6Y1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc3Q9D6Y1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms