Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp2bpQ9D4C6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms