Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx29Q9D3S3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx29Q9D3S3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms