Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pramef12Q9D2F1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.2 ms