Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx17Q9D0I4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx17Q9D0I4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx17Q9D0I4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms