Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpb2Q9CQI7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms