Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim11Q99PQ2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim11Q99PQ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms