Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp4Q99ME9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp4Q99ME9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms