Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms