Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm3Q99LJ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms