Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lysmd3Q99LE3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lysmd3Q99LE3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms