Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf34Q99KR6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf34Q99KR6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms