Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Sdcbp2Q99JZ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Sdcbp2Q99JZ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdcbp2Q99JZ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdcbp2Q99JZ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms