Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX7

Nxf1, Nuclear RNA export factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf1Q99JX7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxf1Q99JX7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nxf1Q99JX7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nxf1Q99JX7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nxf1Q99JX7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nxf1Q99JX7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms