Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfcdQ922L6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NelfcdQ922L6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms