Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usb1Q91W78 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usb1Q91W78 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms