Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg8Q8VE18 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms