Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3il1Q8VDV3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab3il1Q8VDV3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms