Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam20bQ8VCS3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam20bQ8VCS3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam20bQ8VCS3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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