Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ApobrQ8VBT6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ApobrQ8VBT6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms