Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700001C19RikQ8K168 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms