Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d23Q8K0F1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tbc1d23Q8K0F1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms