Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc4a8Q8JZR6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc4a8Q8JZR6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms