Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClasrpQ8CFC7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClasrpQ8CFC7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms