Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam228aQ8CDW1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam228aQ8CDW1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms