Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alx1Q8C8B0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alx1Q8C8B0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms