Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubqln3Q8C5U9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubqln3Q8C5U9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubqln3Q8C5U9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms