Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Sfrp1Q8C4U3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfrp1Q8C4U3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms