Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUP8

Fam43a, Protein FAM43A, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43aQ8BUP8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam43aQ8BUP8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam43aQ8BUP8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam43aQ8BUP8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam43aQ8BUP8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43aQ8BUP8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43aQ8BUP8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43aQ8BUP8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43aQ8BUP8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43aQ8BUP8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43aQ8BUP8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43aQ8BUP8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43aQ8BUP8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam43aQ8BUP8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms