Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem260Q8BMD6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms