Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Usp1Q8BJQ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp1Q8BJQ2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp1Q8BJQ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp1Q8BJQ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp1Q8BJQ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Usp1Q8BJQ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp1Q8BJQ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp1Q8BJQ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp1Q8BJQ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms