Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Frmd3Q8BHD4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmd3Q8BHD4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmd3Q8BHD4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms