Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms