Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrsam1Q80ZI6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrsam1Q80ZI6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms