Protein–RNA interactions for Protein: Q80WG5

Lrrc8a, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8aQ80WG5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc8aQ80WG5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc8aQ80WG5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc8aQ80WG5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc8aQ80WG5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc8aQ80WG5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms