Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Npm2Q80W85 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Npm2Q80W85 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Npm2Q80W85 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms