Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc93Q7TQK5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc93Q7TQK5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc93Q7TQK5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms