Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd3eapQ76KJ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd3eapQ76KJ5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd3eapQ76KJ5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd3eapQ76KJ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd3eapQ76KJ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd3eapQ76KJ5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms