Protein–RNA interactions for Protein: Q6WVG3

Kctd12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd12Q6WVG3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Kctd12Q6WVG3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kctd12Q6WVG3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms