Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ecm29Q6PDI5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms