Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slf2Q6P9P0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Slf2Q6P9P0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms