Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smchd1Q6P5D8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smchd1Q6P5D8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms