Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Szrd1Q6NXN1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms